Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EP400Q96L91 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms