Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTF1AQ7RTS3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTF1AQ7RTS3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms