Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL40Q2TBA0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms