Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRF4Q15306 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms