Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SP140Q13342 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SP140Q13342 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SP140Q13342 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SP140Q13342 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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