Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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TRIM32Q13049 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM32Q13049 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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