Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN11Q06124 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms