Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms