Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rps28P62858 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms