Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP5P45974 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP5P45974 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP5P45974 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP5P45974 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP5P45974 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP5P45974 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP5P45974 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP5P45974 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP5P45974 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP5P45974 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms