Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms