Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CALB2P22676 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CALB2P22676 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CALB2P22676 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms