Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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PKHD1P08F94 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PKHD1P08F94 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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