Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gbp4A4UUI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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