Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC78A2IDD5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC78A2IDD5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms