Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
SRP68Q9UHB9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms