Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAGR1Q9BTK6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAGR1Q9BTK6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms