Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD50Q92878 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms