Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TPGS1Q6ZTW0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms