Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms