Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF5Q13243 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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