Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM25P49756 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM25P49756 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM25P49756 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM25P49756 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBM25P49756 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms