Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTR1BP42025 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms