Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DKK2Q9UBU2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms