Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ChmlQ9QZD5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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ChmlQ9QZD5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChmlQ9QZD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms