Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF541Q9H0D2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF541Q9H0D2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms