Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms