Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
C2orf48Q96LS8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C2orf48Q96LS8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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