Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LTV1Q96GA3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LTV1Q96GA3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms