Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTOP1Q7RTM1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms