Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP1Q702N8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms