Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nop58Q6DFW4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nop58Q6DFW4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms