Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC93Q567U6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms