Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL4Q14135 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL4Q14135 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL4Q14135 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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