Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLN3Q13286 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLN3Q13286 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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