Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms