Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MS4A2Q01362 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms