Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITPNAQ00169 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms