Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX6P78412 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX6P78412 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX6P78412 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX6P78412 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms