Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO4P61968 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO4P61968 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO4P61968 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms