Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NLRP6P59044 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms