Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23AP54725 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms