Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK8P49336 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms