Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNI2P48788 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms