Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTRNP46939 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTRNP46939 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTRNP46939 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms