Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PKHD1P08F94 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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