Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRB1P04280 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRB1P04280 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms