Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPLO60437 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPLO60437 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPLO60437 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPLO60437 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPLO60437 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPLO60437 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPLO60437 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPLO60437 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPLO60437 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPLO60437 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms