Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C9orf172C9J069 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf172C9J069 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms