Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer3W4VSP1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer3W4VSP1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer3W4VSP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer3W4VSP1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms